Сериал «Аля иногда кокетничает со мной по-русски» закручен вокруг, казалось бы, обычной школьной истории. Главный герой, Масатика, учится в престижной академии, но держится особняком, пропуская занятия и избегая общения. Его одноклассница Аля, девушка со смешанными русско-японскими корнями, — полная ему противоположность, яркая и уверенная в себе.

Их миры сталкиваются неожиданным образом. Аля, решив подразнить необщительного парня, начинает заигрывать с ним на русском, будучи уверена, что он ничего не понимает. Этот её маленький секрет становится началом всего. Она не подозревает, что Масатика не только отлично знает язык, но и слышит каждое её слово.

Вся ирония ситуации в том, что их общение строится на этом невольном обмане. Мы наблюдаем за тем, как меняется динамика между ними, пока Масатика решает, стоит ли раскрывать свою тайну. История превращается в тонкую игру, где главное — не сказанные вслух слова, а то, что скрывается за ними.